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黑臭水体产生的原因很多，简单可以概况为以下几个方面。
水动力条件不足作为水体中较为重要的因素之一，水动力条件产生的问题经常导致水体黑臭现象的出现，主要是由于水流流通不畅，直接影响水体水样，对水体造成不同程度上的污染，当水体水质出现恶化时水体将发生黑臭问题。
金属元素污染当水体中出现大量铁元素及锰元素等物质时，在氧气不足的情况下会出现还原现象，使得铁物质与锰物质和水中的硫物质产生反应形成硫化亚铁及硫化锰等物质，导致河道水体呈现黑臭的现象。
有机污染对于水体出现的黑臭现象来说，黑臭现象产生的根本原因就是一种生化的反映现象，水体中的有机物在氧化分解的状态下，耗氧速率明显高出复氧速率，使得水体内的缺氧现象越来越明显，而水体中的厌氧微生物在发生分解状态下会产生硫化氢、甲烷或氨气等恶臭污染物，时间一长将会导致水体发黑及发臭等现象明显。
对于城市水体，污水收集管网建设不完善是黑臭水体存在最主要的原因，部分城中村、城乡结合部没有污水管网，导致污水直接向河道排放。另一方面，某些城市的污水收集管网是污水、雨水混合收集，在雨季时排水量剧增，如果污水处理能力不足，唯一的方法便是将雨水混合污水直排入河流。
黑臭水体治理措施有哪些?
“十三五”期间，通过《水污染防治行动计划》《城市黑臭水体治理攻坚战实施方案》和城市黑臭水体整治环境保护专项行动等，以及新建污水管网、提升污水日处理能力等系列举措，全国295个地级及以上城市(不含州、盟)黑臭水体消除比例为98.2%，总体实现了攻坚战目标，极大改善了人居环境，有力促进了城市高质量发展。
具体到黑臭水体治理措施，可以概况为以下几个方面。
1 截污控源
控源截污是从源头控制污染物进入河道，这是最直接有效的措施，也是其他技术措施的前提。对于城市黑臭水体，一方面要建设完善的污水管网，构建适宜的排水体制和截留技术，对城市排水系统进行科学管理。另外，还需要对底泥进行疏浚修复，切断向上覆水体释放污染物的源头。对于农村黑臭水体，措施包括农村生活污水治理、农村厕所粪污治理、畜禽粪污治理、水产养殖污染防控、种植业污染治理、工业废水污染治理及垃圾清理等。
2 化学处理技术
化学处理常见的方法有强化絮凝、药剂杀藻、活性炭等，主要是采用絮凝沉淀技术，自然水体存在的混凝现象对水质转变有十分显著的影响，水体颗粒物及溶解性的毒害物质通过自然混凝沉淀、迁移、转化，逐渐恢复水体健康。
3 生态治理技术
生态治理技术就是通过创造适宜多种生物生息繁衍的环境，重建并恢复水生态系统，主要包括微生物修复法、水生植物修复法、水生动物修复法等，以增强水体自净能力。可利用土壤-微生物-植物生态系统去除水体中的有机物、氮、磷等污染物，如采用曝气增氧、生态护坡、生态沟渠等方式，促进生态系统恢复。
